政府發言人在7月19日強調這屬於誤解
對於有評論指豁免強制檢疫安排帶來檢疫漏洞，並指安排下的豁免人士是新一波疫情源頭，政府發言人在7月19日強調這屬於誤解 [註一]。7月28日，陳肇始相信疫情和豁免檢疫有關，會嚴肅跟進。
理工大學研究發現第三波疫情的本地個案源頭與輸入個案有關，政府曾經指豁免檢疫人士帶來新一波疫情的說法是「誤解」，食物及衞生局局長陳肇始今日承認現在有了專家實證，相信疫情和豁免檢疫有關，會嚴肅跟進。理大研究團隊由1月疫情開始分析香港確診個案的病毒基因排序，發現第一波疫情即是1月由武漢或廣東省輸入的個案主要是S型及L型病毒株，到2月另一款內地輸入的V型病毒株在香港落地生根，引發打邊爐群組、北角佛堂群組、青衣長康邨康美樓的傳播。
到3月歐美爆發疫情，政府要求機場抵港的人居家檢疫14日，但飛機師及海員等可豁免，大批人隨即從海外返港，引發第二波疫情，這些輸入個案屬於G型病毒株，特點是傳播力強，亦是引致歐美大爆發的主因。疫情之後稍見紓緩，政府6月初放寬海員換班，入境只是要醫學監察。
7月初開始出現本地爆發，G型病毒株演變成GR型，多個感染群組，包括彬記、港泰護老院、慈雲山街市、水泉澳邨及北角補習社等，都是這款病毒，基因排序與菲律賓輸入的個案相似 [註二]。
8月13日，食衛局：嚴肅跟進唔係跟進漏洞、一路都無話船員豁免係漏洞。
食物及衛生局局長陳肇始上月底（7月28日）接受港台訪問時承認，基因排序的發現是「有效的實證」，當局會「好嚴肅咁去跟進」。眾新聞向食衛局查詢「嚴肅跟進」的進度如何、可有人需要問責，昨日獲回覆請記者看三篇舊的新聞稿，食衛局局長新聞秘書口頭補充：「我哋政府一路無話船員（豁免）嗰個係漏洞」、「我唔明負責啲乜嘢，因為我哋都無話係一個（漏洞），點解會有個人需要負責。」[註三]
8月27日，林鄭月娥：本港第三波疫情很大可能涉及海員或機員過境
行政長官林鄭月娥表示，本港第三波新型肺炎疫情，很大可能與海員或機組人員過境有關，又說政策執行過程時不太完善，發現有部分海員逗留本港時走入社區。林鄭月娥接受鳳凰衞視訪問表示，豁免海員及機組人員檢疫時，已要求航空及海運公司安排員工到特定酒店，但有海員走到社區，政府知道問題後已經馬上堵塞，目前已暫停海員於本港換班的安排，亦難以放寬 [註四]。
陳沛然議員
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